周培公(李明 饰)与副将图海率军势如破竹，很快灭了察哈尔王叛军。解除朝廷危机后，又挥师西南直逼吴三桂叛军。羁留京中的王辅臣儿子王吉贞(赵凯 饰)，带着康熙(陈道明 饰)亲笔御信，火速面见王辅臣。康熙在信中恩威并施，并表明必胜吴三桂的信心，但王辅臣仍持观望态度。

原先以为王吉贞被朝廷大炮轰死的王辅臣，见儿子平安归来，终于投向朝廷阵营。康熙见王辅臣归顺大喜，但明珠提出应节制周培公。周培公率军南下，吴三桂屡遭重创。吴三桂登基称皇，企图鼓舞士气。京城来旨，调周培公回京，把最后取胜吴三桂的机遇让给图海。

经过五年奋战，康熙终于平定“三藩”。