房遗爱(潘粤明 饰)逼迫高阳找父皇要官，逼迫高阳为他生儿子。高阳求房遗直为她想办法，房遗直亦不敢对房遗爱怎样，只能让辩机(聂远 饰)停止译经，前往益州投奔吴王恪。辩机断然拒绝了房遗直。高阳只好进宫请求父皇给房遗爱更大的官爵。李世民(唐国强 饰)看了玄奘(徐少华 饰)口述辩机撰写的《大唐西域记》，对辩机的才华赞不绝口，高阳觉得这或许是她和辩机命运的转机。

恰在这时，房玄龄(岳跃利 饰)病重，李世民和高阳一同赶往房府。房玄龄临终遗言，如果高阳想离开房家，请皇上恩准。高阳满怀希望地把自己和辩机的命运联系在一起。房遗直直言告诉高阳，辩机翻译佛经或许要用尽一生的时间和智慧。高阳把珍藏多年的玉枕拿出来，托庶戒带给辩机，以示终生相守，辩机没有接受。

压抑多年的庶戒，把玉枕送到御史台，告发了辩机。长孙无忌(强子 饰)答应庶戒顶替辩机译经大德的位置，以让他招出更多内幕人物。长孙无忌的马队包围了净土寺。辩机被捕前，把译好的经文恭恭敬敬捧给师父。房遗直把辩机被捕的消息带回房府，高阳决定把全部事情揽到自己身上。

房遗爱感到大祸临头了。第30集长孙无忌把案情报告给李世民，李世民让长孙无忌不要牵扯吴王恪和高阳，长孙无忌则表示为难，因为他知道这正是他除去吴王恪的大好机会。玄奘与李世民的会见是十分尴尬的，他们的徒弟和女儿给他们的脸上摸了黑。

玄奘再三为辩机求情，李世民不允。高阳得知辩机被定谋反罪--死罪，闯进宫中与父皇理论，要自己承担责任。李世民为高阳的所作所为痛心疾首，终于一病不起。房遗爱私找长孙无忌为自己开脱责任，长孙无忌暗示房遗爱，只有把吴王恪拉下水，房家才能自保。

房遗爱找高阳商量对策，高阳不答应他的要求，房遗爱就把六岁儿拉出来威胁高阳。如果高阳不配合长孙无忌办案，他就把六岁儿交出去。高阳急中生智，对房遗爱说六岁儿是她与房遗直所生。房遗爱质问房遗直，房遗直为了高阳默认下来，令房遗爱异常羞怒。

房遗直为成全高阳和辩机，用钱买通狱头，使高阳有机会和辩机见面并说服辩机一同前往吴王恪所在的益州，却被辩机断然拒绝。高阳与辩机的诀别令房遗直万分不忍，他要替代辩机去死以成全这对恋人，遭到辩机拒绝。高阳泪水淋漓地告别了辩机。

第31集李世民在病中惦念着吴王恪和高阳，嘱咐太子治要善待他兄妹二人。皇上病危，武则天(秦岚 饰)担心皇上一旦驾崩，自己会被送进尼姑庵。太子治向武则天发誓，永远爱她，不离不弃。辩机行刑前夜，玄奘前往狱中为辩机祈祷，师弟话别。

辩机的囚车驶过长安大街，驶向西市刑场。刑前，孚由献上最后的圣餐。辩机咀嚼着黑乎乎的老咸菜，望着孚由说，真好吃。孚老汉入殓辩机，把那只豪华的玉枕放在辩机的颈下。高阳为六岁儿放弃了殉情的念头。雨夜，庶戒坐在辩机译经的位置上被房遗直假扮的孤魂吓死了。

李世民在他的弥留之际召见了玳姬(张彤 饰)和杨妃(颜丹晨 饰)，表达了他爱的遗憾。当吴王恪赶到父皇病榻前的时候，皇上已经驾崩，太子治已经继位，是为高宗