三百年后，奎刚(刘德凯 饰)已经完全幻化为人形。奎刚带领众妖杀入三界。而天庭出现了蟠桃都在一夜之间枯烂坏死等异象。玉帝感叹，浩劫将至，此乃定数。太上老君交代自己的弟子云居真人，自己西去后精元合一，会成为一颗上清金丹，要将此交到石敢当(张子健 饰)手中。

天界、冥界、重华宫全都大乱。奎刚带领众多妖怪杀进了凌霄殿。玉帝感慨这是劫数，无论动与不动结果都是一样的。他道：“众皆一心，唯吾二心；黑衣穹高，领辖三界；真性灵投，入释凡家；他日重生，回归三界；石中武圣，方解此厄；乾坤清朗，善心归一”之后便化为金像，从此天界便无玉帝。

众神含泪。实际上玉帝并未死亡，而是在投生在凡间的刚出生的男婴身上。在阿修罗界，奎刚制作了巨大的作房，妖怪只要通过这个作坊的机器就可以变换模样并去除一身妖气，就算是法力高强的人也看不出来。黑莲圣使变为哪吒(韩含 饰)模样。

在太上老君丹房内，由于金丹帮助云居真人隐藏了身形和气味，使得云居真人躲开了搜查，成功躲过。武德星君和水德星君叛投奎刚，而其他神的元神则都被吸入黑链之内。